欢迎来到生物信息学与计算生物学课堂!

本课堂是由刘付峰、彭冲、夏梦雷三位老师主讲的课程，旨在帮助学生了解并掌握最基础的生物信息和计算生物学的研究内容、策略、方法和工具。本课堂部分内容由研究生祝雅楠、闫欣瑶，本科生陈林、田中煜、朱振昊五位同学协助建设完成。

本课堂不设置考试。课程成绩由出勤、课堂作业构成。

Contents:

• 1. 课前准备
  • 1.1. Snapgene
  • 1.2. Python
  • 1.3. Pycharm
• 2. 开场需要探讨的几个问题
  • 2.1. 生物相关工程的“就业窘境”
  • 2.2. 为什么要学习计算生物学
• 3. 从Snapgene开始: 我不再是“吹起来天下无敌，做起来无能为力”的生物人
• 4. 编程的逻辑-python基本语法快速入门:我要吹，所有的编程语言都是一个样
  • 4.1. 软件安装
  • 4.2. 数据类型：杯子还是水缸，10000还是1的问题?
  • 4.3. 数据类型：拿什么来装数据？
  • 4.4. 字符串：生物就是搞这个的
  • 4.5. 条件与循环：计算机就是靠它打败人类的
  • 4.6. 函数：抽象的才是精华
  • 4.7. 对象：学生最不可告人的想法
  • 4.8. 异常：跟计算机学习如何找男女朋友
• 5. 我的第一款软件：我要强大到自我膨胀
  • 5.1. 如何下载1000篇文献：我真的可以靠他挣钱
  • 5.2. 如何获得最新的科研信息：谁谁谁很牛？我来揭个底
  • 5.3. 如何设计基因电路：我不再是只会做实验的“体力劳动者”
• 6. 分子实验自动化与智能化工具：Dna Features Viewer（不做讲解）
  • 6.1. 方法说明
  • 6.2. 用法说明书
• 7. 7. Python生物信息随堂作业
  • 7.1. 7.1 ATP能量计算
  • 7.2. 氨基酸序列分析
  • 7.3. Pymol小实例（看氨基酸长什么样子）
• 8. 2021年 授课安排
  • 8.1. Class 1-2:智能计算在生物工程领域的应用
  • 8.2. Class 3-4:编程语言介绍与代谢通量分析
  • 8.3. 本学期期末作业
• 9. 本课程课堂视频
  • 9.1. 课堂视频
  • 9.2. 课堂视频

课前动员

• 课前动员
  • 课前动员：为什么要学这门课（视频）
  • Biotechnology Future of Everything

关于我们

朱振昊 zhuzhenhao02@163.com	田中煜 1135669815@qq.com	陈林 1185372264@qq.com

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